RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 HIGD1CA8MV81 97 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 K7EMT4 169 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 TCTAP57738 103 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 WT1-ASQ06250 92 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6AWC8 147 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-207ENST00000484547 SPINK4O60575 86 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 CTSGP08311 255 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-207ENST00000484547 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 OTORQ9NRC9 128 aa8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-207ENST00000484547 TCRAP04437 139 aa8.53□□□□□ -1.04
RABGEF1-207ENST00000484547 MED14OSP0DP75 135 aa8.53□□□□□ -1.04
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-207ENST00000484547 TAX1BP3O14907 124 aa8.52□□□□□ -1.05
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RABGEF1-207ENST00000484547 CSN1S1P47710 185 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01559Q495D7 138 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 GTSF1Q8WW33 167 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00479Q96M42 142 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.5□□□□□ -1.05
RABGEF1-207ENST00000484547 MFAP4P55083 255 aa8.5□□□□□ -1.05
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