RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE12JA6NER3 117 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE7O76087 117 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE12FP0CL80 117 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE12GP0CL81 117 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE12IP0CL82 117 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE4Q13068 117 aa12.48□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NBR2O15453 112 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC3BP05452 202 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 RPL11P62913 178 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PIEZO1Q92508 2521 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 F5H697 171 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CRYGBP07316 175 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf31Q8N9H6 132 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CSPG4Q6UVK1 2322 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV2A0A0B4J234 112 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM262E9PQX1 116 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A20O43772 301 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ZFHX3Q15911 3703 aa12.47□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS2P07478 247 aa12.46□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf66Q6UXQ4 117 aa12.46□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.46□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.46□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa12.46□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf64Q2M2E5 130 aa12.46□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.46□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KLRB1Q12918 225 aa12.46□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PDE6HQ13956 83 aa12.46□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PIFOQ8TCI5 191 aa12.46□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PPR1 153 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 HERVK_113P61574 105 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ECSCRQ19T08 205 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MSRB2Q9Y3D2 182 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NDPQ00604 133 aa12.45□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 VPS13CQ709C8 3753 aa12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PKD1L2Q7Z442 2459 aa12.44□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 FAM159AQ6UWV7 190 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 AJUBAQ96IF1 538 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CRLF1O75462 422 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 IFITM1P13164 125 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00527Q9UJ94 153 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ITPR1Q14643 2758 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SORL1Q92673 2214 aa12.43□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 POLQO75417 2590 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01559Q495D7 138 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ORMDL2Q53FV1 153 aa12.42□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LY6LH3BQJ8 138 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NPC2P61916 151 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZS46 218 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf53Q8NAA6 179 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DEFB1P60022 68 aa12.41□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ACACBO00763 2458 aa12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 BAALCQ8WXS3 180 aa12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 VCX2Q9H322 139 aa12.4□□□□□ -0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RPL32P62910 135 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 NRACQ8N912 160 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 FLNCQ14315 2725 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf86A6NJI1 115 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 FAM74A4Q5TZK3 123 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 RASL10AQ92737 203 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf92Q96LL3 132 aa12.39□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 A4D1N5 150 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC19AQ6UXS0 136 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf126Q8N4M7 172 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CFC1BP0CG36 223 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CFC1P0CG37 223 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM219Q86XT9 240 aa12.38□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 159.8 ms