RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483062.5

SYN3-212, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 3

Gene SYN3, Length 827 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-212ENST00000483062 TRGV11A0A075B6L2 103 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 XKRY2A2RUG3 117 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 LINC00862A6NCI5 91 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZNF727A8MUV8 499 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 J3KRW8 73 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 GCGP01275 180 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 CEBPGP53567 150 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 XGP55808 180 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 Q8TAT8 98 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SGK494Q96LW2 274 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PARLQ9H300 379 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.51□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 EMP1P54849 157 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 NDUFA5Q16718 116 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TMEM241Q24JQ0 296 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TDRG1Q3Y452 100 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 CENPWQ5EE01 88 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 C16orf74Q96GX8 76 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 MLST8Q9BVC4 326 aa5.5□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 CBY3A6NI87 242 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SNURFLB1AK76 121 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ORM1P02763 201 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 BTN1A1Q13410 526 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TVP23CQ96ET8 276 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 C18orf15Q96N68 181 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 NAT8Q9UHE5 227 aa5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 LYRM9A8MSI8 78 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 B4DEV8 164 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 P01737 135 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 CXCL1P09341 107 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 HTN1P15515 57 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 DAD1P61803 113 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZNF415Q09FC8 603 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 OR5I1Q13606 314 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 Q5VSD8 79 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 COMMD7Q86VX2 200 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 C15orf53Q8NAA6 179 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 C8orf49Q96NF6 230 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SPXQ9BT56 116 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 DERL1Q9BUN8 251 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.48□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PPP1R2P9O14990 202 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SH2D1AO60880 128 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 SFTA3P0C7M3 94 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 HTN3P15516 51 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 ASIPP42127 132 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 PRR27Q6MZM9 219 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 FAM231DQ6ZW35 169 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 OCC1Q8TAD7 63 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 NAGKQ9UJ70 344 aa5.47□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
SYN3-212ENST00000483062 A0A1W2PPQ1 181 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 TMEM218A2RU14 115 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 A8MWL6 223 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 F8W036 122 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 CIDEAO60543 219 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 ERVFC1-1P60608 527 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 KIR3DS1Q14943 382 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 MUC21Q5SSG8 566 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 DNLZQ5SXM8 178 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 PRR9Q5T870 116 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 LINC01551Q86U37 167 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
SYN3-212ENST00000483062 SEC11CQ9BY50 192 aa5.46□□□□□ -1.54
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