RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LTB-212ENST00000482429 BIN3Q9NQY0 253 aa14.65□□□□□ -0.06
LTB-212ENST00000482429 ORM1P02763 201 aa14.64□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.64□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 SFRP2Q96HF1 295 aa14.64□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.63□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.63□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 C16orf90A8MZG2 172 aa14.63□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 HTN1P15515 57 aa14.63□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 LINC01587Q99440 93 aa14.63□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 P01737 135 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 OSTCQ9NRP0 149 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa14.62□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 C7orf77A4D0Y5 90 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 GZMBP10144 247 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 SVBPQ8N300 66 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.61□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 B4DEV8 164 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 GNRH2O43555 120 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 DKK2Q9UBU2 259 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 V9GYV3 84 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 SNAPINO95295 136 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 FAM159AQ6UWV7 190 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.6□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 MT-ND4LP03901 98 aa14.59□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 EMP1P54849 157 aa14.59□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 LINC01559Q495D7 138 aa14.59□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.59□□□□□ -0.07
LTB-212ENST00000482429 H7BYZ3 331 aa14.58□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 AZU1P20160 251 aa14.58□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 S100A1P23297 94 aa14.58□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TNP2Q05952 138 aa14.58□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 Q8N1X5 172 aa14.58□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 CBY3A6NI87 242 aa14.57□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TYMSP04818 313 aa14.57□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.57□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TCL1AP56279 114 aa14.56□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 RHEBQ15382 184 aa14.56□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.56□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.56□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.56□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.55□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 PPP1R2P9O14990 202 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 HTN3P15516 51 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TDRG1Q3Y452 100 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 KCNS1Q96KK3 526 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 MDFICQ9P1T7 246 aa14.54□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 A8MWL6 223 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 SCO1O75880 301 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 ASIPP42127 132 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 GTSF1Q8WW33 167 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 TPPP3Q9BW30 176 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.52□□□□□ -0.08
LTB-212ENST00000482429 A0A087WWC5 75 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 H3BVH4 76 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 SSTP61278 116 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 RRN3P1Q2M238 152 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 C6orf223Q8N319 242 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 TSKUQ8WUA8 353 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 IL36BQ9NZH7 164 aa14.51□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 HERC1Q15751 4861 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 CT83Q5H943 113 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.5□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 XKRY2A2RUG3 117 aa14.49□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.49□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.48□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 SPINK4O60575 86 aa14.48□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 IGLC6P0CF74 106 aa14.48□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 DAD1P61803 113 aa14.48□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.48□□□□□ -0.09
LTB-212ENST00000482429 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms