RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 M0R036 132 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 LINC01559Q495D7 138 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 DNLZQ5SXM8 178 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 DERL1Q9BUN8 251 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 BIRC6Q9NR09 4857 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 IL36BQ9NZH7 164 aa14.47□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 IFNA1P01562 189 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 BCL2P10415 239 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 UPK3BQ9BT76 320 aa14.46□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 H3BVH4 76 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.45□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 K7EQD1 137 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 CIDEAO60543 219 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 Q9H8V8 135 aa14.44□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 RTL8CO15255 209 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 PDE6DO43924 150 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 GYPEP15421 78 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 BLOC1S1P78537 153 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 VAX2Q9UIW0 290 aa14.43□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 IGLV2-8P01709 118 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 LYPD6BQ8NI32 183 aa14.42□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 RAB19A4D1S5 217 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 SRIP30626 198 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 CENPWQ5EE01 88 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 LYPD5Q6UWN5 251 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 NEGR1Q7Z3B1 354 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 JPT2Q9H910 190 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 MED9Q9NWA0 146 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.41□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 PRR27Q6MZM9 219 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 PARLQ9H300 379 aa14.4□□□□□ -0.1
ACTB-211ENST00000480301 A8MWV9 139 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.39□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 CXCL1P09341 107 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 SYT8Q8NBV8 401 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.38□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 MED14OSP0DP75 135 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 GNG4P50150 75 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZSN1 163 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 SMIM12Q96EX1 92 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.37□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 NXPH4O95158 308 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 RHOHQ15669 191 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.36□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 M0R381 172 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 SFRP2Q96HF1 295 aa14.35□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 SIVA1O15304 175 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 ZFP82Q8N141 532 aa14.34□□□□□ -0.11
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPQ1 181 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 SNAI2O43623 268 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 CRYGDP07320 174 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 TTC32Q5I0X7 151 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 SOHLH1Q5JUK2 328 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 C6orf223Q8N319 242 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.33□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVY2 172 aa14.32□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WWL8 130 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 TMEM250H0YL14 139 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 RHODO00212 210 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 OR5AL1P0C617 328 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 TIRAPP58753 221 aa14.31□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.3□□□□□ -0.12
ACTB-211ENST00000480301 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
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