RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478378.5

TIMM17A-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17A, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-202ENST00000478378 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC01620Q4KN68 170 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 KHDC3LQ587J8 217 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC51BQ86UW2 128 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 IQCF2Q8IXL9 164 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 RAB24Q969Q5 203 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 FXYD5Q96DB9 178 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 OR51M1Q9H341 326 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.43□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 A0A1B0GV50 99 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 NDUFB4O95168 129 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 GPX1P07203 203 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 SEC11BP0C7V7 166 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 STAG3L2P0CL84 134 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 STAG3L3P0CL85 134 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 GCHFRP30047 84 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 ASIPP42127 132 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 GUK1Q16774 197 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM213BQ8TBF2 198 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF479Q96JC4 524 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 M0R3E3 92 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 IGLV2-11P01706 119 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 MT1HL1P0DM35 61 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 CRISP2P16562 243 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 ERCC8Q13216 396 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.41□□□□□ -1.7
TIMM17A-202ENST00000478378 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 UMAD1C9J7I0 102 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF253O75346 499 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 CXorf1O96002 111 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 NMBP08949 121 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 SULT1A2P50226 295 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 UBE2G2P60604 165 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 RANP62826 216 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 PDE6HQ13956 83 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TOR2AQ5JU69 321 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 PRR9Q5T870 116 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 LINC00477Q96M19 166 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.4□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 GGTLC3B5MD39 225 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 GNG5P63218 68 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 MUC21Q5SSG8 566 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 LELP1Q5T871 98 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 Q8N976 141 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 SUN5Q8TC36 379 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 SFT2D1Q8WV19 159 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 BAALCQ8WXS3 180 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 RASL10AQ92737 203 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 SPXQ9BT56 116 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM167BQ9NRX6 74 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 PRELID1Q9Y255 219 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 COX11Q9Y6N1 276 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 PGPA6NDG6 321 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 RAB5CP51148 216 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 CCL20P78556 96 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 LCE4AQ5TA78 99 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 Q6ZQT7 251 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 Q6ZRU5 148 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.38□□□□□ -1.71
TIMM17A-202ENST00000478378 Q8TAT8 98 aa4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms