RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477941.2

PDE4DIP-212, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4DIP, Length 586 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-212ENST00000477941 SMUG1Q53HV7 270 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 LELP1Q5T871 98 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 SUN5Q8TC36 379 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 EPDR1Q9UM22 224 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 ALG5Q9Y673 324 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q8N814 137 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 CXorf1O96002 111 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 MBP02144 154 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q6ZSN1 163 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q8N3U1 123 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 PTH2Q96A98 100 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 LINC00479Q96M42 142 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 AQP10Q96PS8 301 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 SERF2P84101 59 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.72□□□□□ -1.01
PDE4DIP-212ENST00000477941 GAGE12JA6NER3 117 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM229AH3BQW9 127 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 GAGE1Q13065 139 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 GAGE4Q13068 117 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 GAGE5Q13069 117 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 LAGE3Q14657 143 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 GAGE13Q4V321 117 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q5BKY6 102 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 MED28Q9H204 178 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 PARLQ9H300 379 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.71□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A1W2PRE2 83 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 A8MWV9 139 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 IFNA7P01567 189 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 ASIPP42127 132 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 WFDC2Q14508 124 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 TM2D2Q9BX73 214 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q9UF83 564 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.7□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 LINC00694P0DN24 101 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 UBE2G2P60604 165 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 JPT2Q9H910 190 aa8.69□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 H3BVH4 76 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 PEX7O00628 323 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 LECT2O14960 151 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZNF726P1Q15940 193 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 Q86TA4 180 aa8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 RNF222A6NCQ9 220 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 B4DEV8 164 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 M0R036 132 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 PTTG1O95997 202 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 IL36BQ9NZH7 164 aa8.67□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A087WWC5 75 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 C1QBP02746 253 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 CRIP1P50238 77 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 SYT8Q8NBV8 401 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.66□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM74A7A6NL05 159 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 TOR2AQ5JU69 321 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.65□□□□□ -1.02
PDE4DIP-212ENST00000477941 A0A087WWL8 130 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4DIP-212ENST00000477941 RHODO00212 210 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4DIP-212ENST00000477941 SH2D1AO60880 128 aa8.64□□□□□ -1.03
PDE4DIP-212ENST00000477941 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.9 ms