RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 IGLV2-11P01706 119 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 PRNTQ86SH4 94 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 LINC00479Q96M42 142 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 PSG8Q9UQ74 426 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 GGTLC3B5MD39 225 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 SSNA1O43805 119 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 TCRAP04437 139 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 TM2D2Q9BX73 214 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 PARLQ9H300 379 aa7.36□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 TAAR5O14804 337 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 C1QBP02746 253 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 LINC00694P0DN24 101 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 GCHFRP30047 84 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 LAGE3Q14657 143 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 UPK1BO75841 260 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 RAB24Q969Q5 203 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 IGLV2-8P01709 118 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 SMUG1Q53HV7 270 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 KLK12Q9UKR0 248 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 EPDR1Q9UM22 224 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WWL8 130 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 H3BVH4 76 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 M0R036 132 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 STAG3L2P0CL84 134 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 STAG3L3P0CL85 134 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.32□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 PET100P0DJ07 73 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 UBE2G2P60604 165 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 NIT1Q86X76 327 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 SUN5Q8TC36 379 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 S100ZQ8WXG8 99 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 PTH2Q96A98 100 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 UBE2WQ96B02 151 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.31□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 RNF222A6NCQ9 220 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 CIDEAO60543 219 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V0CP27449 155 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ASIPP42127 132 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 CRIP1P50238 77 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ZFP69Q49AA0 526 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 Q5BKY6 102 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa7.3□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 RNF213Q63HN8 5207 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 A8MWV9 139 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 B4DEV8 164 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 K7EQM0 130 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ZNF726P1Q15940 193 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.29□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 SH2D1AO60880 128 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 IFNA7P01567 189 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 DEFA3P59666 94 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 TOR2AQ5JU69 321 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 Q86TA4 180 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 Q8N976 141 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-209ENST00000473257 A0A087WWC5 75 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 M0R381 172 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 PEX7O00628 323 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-209ENST00000473257 CXorf1O96002 111 aa7.27□□□□□ -1.25
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