RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PRO1933Q9H354 126 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TSTD3H0UI37 97 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SMKR1H3BMG3 65 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 M0R2Z0 102 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA7O95182 113 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SCGB1D1O95968 90 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF688P0C7X2 276 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 ID1P41134 155 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 HILS1P60008 231 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 KRTDAPP60985 99 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TWIST1Q15672 202 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 RAX2Q96IS3 184 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf85Q96MD7 179 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TPPP3Q9BW30 176 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 AP5S1Q9NUS5 200 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 NACAE9PAV3 2078 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.18□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf71A4D174 169 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 H3BVH4 76 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 M0R381 172 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TCF21O43680 179 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 NCR2O95944 276 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DRB4P13762 266 aa4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 PROK1P58294 105 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 PMCHL1Q16048 86 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 PSMG4Q5JS54 123 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 OR11H1Q8NG94 326 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01006Q8NI28 216 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 LEPROTL1O95214 131 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 IGLC3P0DOY3 106 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 CD28P10747 220 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 CKS2P33552 79 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ASIPP42127 132 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RIPPLY3P57055 190 aa4.16□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N8P6 123 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RASL10AQ92737 203 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 MRAP2Q96G30 205 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 DUX3Q96PT4 197 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 VAMP8Q9BV40 100 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf202A1L168 122 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 EREGO14944 169 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 SPRY2O43597 315 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-210ENST00000462363 MAJINQ3KP22 176 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 LCE4AQ5TA78 99 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 FA2HQ7L5A8 372 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 PTH2Q96A98 100 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-210ENST00000462363 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.15□□□□□ -1.75
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