RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M6PRP20645 277 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RANP62826 216 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSG9Q00887 426 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMTNQ6UX39 209 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAP18Q8IXM2 172 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RARRES2Q99969 163 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MDFICQ9P1T7 246 aa5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMSDA8MTL9 139 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF726P1Q15940 193 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KHDC3LQ587J8 217 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKAP14Q86UN6 197 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IQCF2Q8IXL9 164 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HYLS1Q96M11 299 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.9□□□□□ -1.46
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GV50 99 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCL2L11O43521 198 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PFDN1O60925 122 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMP1P54849 157 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAS2R45P59539 299 aa5.89□□□□□ -1.47
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF345Q14585 488 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GUK1Q16774 197 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8TAT8 98 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q9H3A6 140 aa5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0D9SG52 128 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A8MTW9 85 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAAR5O14804 337 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAG3L2P0CL84 134 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCHFRP30047 84 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2G2P60604 165 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERF2P84101 59 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8NAQ8 132 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC7Q8TAX7 377 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTSF1Q8WW33 167 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIR2DL4Q99706 377 aa5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PGPA6NDG6 321 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MBP02144 154 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1QBP02746 253 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HTN1P15515 57 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE6HQ13956 83 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR9Q5T870 116 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6ZQT7 251 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C6orf223Q8N319 242 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM208Q9BTX3 173 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CELA1Q9UNI1 258 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.87□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXorf1O96002 111 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INSP01308 110 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AZU1P20160 251 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTN1A1Q13410 526 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VSIG2Q96IQ7 327 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRELID1Q9Y255 219 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RYR3Q15413 4870 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RYR2Q92736 4967 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GGTLC3B5MD39 225 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAPINO95295 136 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSN1S1P47710 185 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q1RN00 199 aa5.85□□□□□ -1.47
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.85□□□□□ -1.47
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