RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443667.1

PDZK1-204, Transcript of PDZ domain containing 1, human

TSL 5

Gene PDZK1, Length 1,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDZK1-204	ENST00000443667	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A087WWL8	130 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SCGB1D2	O95969	90 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	COX6A2	Q02221	97 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MPV17L2	Q567V2	206 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MZT2A	Q6P582	158 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	STPG4	Q8N801	248 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	JPT2	Q9H910	190 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RAB26	Q9ULW5	256 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TCRB	P04435	133 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PPP1R1A	Q13522	171 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RBAKDN	A6NC62	111 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TSC22D2	O75157	780 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SFT2D2	O95562	160 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CSN1S1	P47710	185 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CACNG7	P62955	275 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MIA	Q16674	131 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CCS	O14618	274 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SMIM18	P0DKX4	95 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667		Q6ZRP5	223 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	GGACT	Q9BVM4	153 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	VCX3B	Q9H321	246 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	CST7	O76096	145 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	BAX	Q07812	192 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RGS5	O15539	181 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	RAB5C	P51148	216 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	IL18	Q14116	193 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	AP3S1	Q92572	193 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	SGK494	Q96LW2	274 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PDZK1-204	ENST00000443667		A0A096LNI7	61 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667		A8MWV9	139 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	CTDSP2	O14595	271 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	TAS2R30	P59541	319 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	MCFD2	Q8NI22	146 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	PTH2	Q96A98	100 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	PTTG1	O95997	202 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	IFNA7	P01567	189 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PDZK1-204	ENST00000443667	FGF7	P21781	194 aa		5.32	□□□□□ -1.56

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