RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BRN7 92 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV1-17P01599 117 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZS46 218 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.45□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YY99 117 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L23D6RBM5 183 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 LHBP01229 141 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV4-39P01824 125 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 COX6B1P14854 86 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTFRP26992 372 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM27E3Q08E93 113 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 NRACQ8N912 160 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 S4R3C0 116 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 DMDP11532 3685 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 EMP1P54849 157 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF56Q15929 161 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 ZZEF1O43149 2961 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 CNFNQ9BYD5 112 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-30P01768 117 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 ELANEP08246 267 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DMBP28068 263 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.43□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM23O14925 209 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 GNLYP22749 145 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 PRO0628Q9UI54 55 aa6.42□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2WQ96B02 151 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF7Q9UBF6 113 aa6.41□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf195Q5TG92 126 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.41□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM86BQ8N661 226 aa6.41□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.41□□□□□ -1.38
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RABGEF1-203ENST00000439720 NPFFO15130 113 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.39□□□□□ -1.39
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