RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 M0R036 132 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.93e-10■□□□□ 9.6
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PRAME-209ENST00000439106 PPT1P50897 306 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 CST9LP1Q5W188 147 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-209ENST00000439106 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.41□□□□□ -0.9
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PRAME-209ENST00000439106 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 IL36BQ9NZH7 164 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 A8MWV9 139 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.34□□□□□ -0.91
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PRAME-209ENST00000439106 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 Q8N3U1 123 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-209ENST00000439106 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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PRAME-209ENST00000439106 A0A087WWL8 130 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 M0R381 172 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 CIDEAO60543 219 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 IGHV3-30P01768 117 aa9.33□□□□□ -0.92
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PRAME-209ENST00000439106 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 CDK2AP2O75956 126 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 LINC00694P0DN24 101 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 TIRAPP58753 221 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 ERVFC1-1P60608 527 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 DNLZQ5SXM8 178 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-209ENST00000439106 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.32□□□□□ -0.92
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