RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438354.6

LYVE1-202, Transcript of lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1, humanhuman

TSL 5

Gene LYVE1, Length 1,823 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1-202ENST00000438354 SRIP30626 198 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 KRTAP10-11P60412 298 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 GNG5P63218 68 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 OR8I2Q8N0Y5 310 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 TENM3Q9P273 2699 aa5.29□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 PRAC2D3DTV9 90 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 J3KT08 172 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 M0R3E3 92 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 SOCS3O14543 225 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 IGLV1-51P01701 117 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 GCHFRP30047 84 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
LYVE1-202ENST00000438354 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 F6UB75 175 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 APOC4P55056 127 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 DCANP1Q8TF63 244 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RARRES2Q99969 163 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PAXXQ9BUH6 204 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 COL7A1Q02388 2944 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 GGTLC3B5MD39 225 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 UMAD1C9J7I0 102 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 C9JQL5 133 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 CD7P09564 240 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ATP5G3P48201 142 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 KRTAP10-2P60368 255 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 GDF5OSQ5U4N7 250 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa5.27□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF688P0C7X2 276 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 FAM236CP0DP71 79 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 AMTP48728 403 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 Q9HAA7 133 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.26□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TMEM218A2RU14 115 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 K7EQG2 157 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 IFNA7P01567 189 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 CTRLP40313 264 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PMAIP1Q13794 54 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 GUCA2BQ16661 112 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 KHDC3LQ587J8 217 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TMEM101Q96IK0 257 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 LINC00479Q96M42 142 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 GNG13Q9P2W3 67 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 A0A087WZ39 114 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 A6NDN8 102 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 CXorf1O96002 111 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 EVI2AP22794 236 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 RAB5CP51148 216 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 Q6ZVQ6 151 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 LINC00052Q96N35 136 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 Q9H3A6 140 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.25□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 A0A0U1RQV1 116 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 A0A1W2PS18 150 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 KNCNA6PVL3 124 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 EMP1P54849 157 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 PSMG4Q5JS54 123 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 CLLU1Q5K131 121 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 C9orf66Q5T8R8 295 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.24□□□□□ -1.57
LYVE1-202ENST00000438354 Q6ZQT7 251 aa5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms