RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 CDIP1Q9H305 208 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 VMO1Q7Z5L0 202 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 RASL10AQ92737 203 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.76□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 CLPSL1A2RUU4 121 aa11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 TSPAN13O95857 204 aa11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 BAALCQ8WXS3 180 aa11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.75□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 SCGB2A1O75556 95 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 LY6G5BQ8NDX9 201 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 C16orf92Q96LL3 132 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ATP6V0E1O15342 81 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ARL3P36405 182 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 XGP55808 180 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 MRAP2Q96G30 205 aa11.74□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 KIR2DL4Q99706 377 aa11.73□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 TOMM6Q96B49 74 aa11.73□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 C20orf173Q96LM9 149 aa11.73□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC140Q96MF4 163 aa11.73□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 GNRH2O43555 120 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 GATA3P23771 443 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 CARD19Q96LW7 228 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ODF3BA8MYP8 253 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZS46 218 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 Q8N9W7 124 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.72□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 F6UB75 175 aa11.71□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 H7C2G1 150 aa11.71□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 GNLYP22749 145 aa11.71□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 PRTN3P24158 256 aa11.71□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.71□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.71□□□□□ -0.53
SFRP4-201ENST00000436072 RBAKDNA6NC62 111 aa11.71□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 C19orf84I3L1E1 186 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TCL1BO95988 128 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 METTL26Q96S19 204 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 C11orf86A6NJI1 115 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 PRSS47A8MTI9 375 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 RPL39P62891 51 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZUT4 128 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 JPT2Q9H910 190 aa11.7□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 POLQO75417 2590 aa11.69□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.69□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 RAX2Q96IS3 184 aa11.69□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.69□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 Q8N6K4 173 aa11.69□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.68□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 A6NJY4 79 aa11.68□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.68□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 RNF183Q96D59 192 aa11.68□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 RNF223E7ERA6 249 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 CRYGDP07320 174 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2D1P51668 147 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM219Q86XT9 240 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 CD7P09564 240 aa11.67□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.66□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 COX6B1P14854 86 aa11.66□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 SRD5A1P18405 259 aa11.66□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.66□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TSHBP01222 138 aa11.66□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 ASIPP42127 132 aa11.66□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 A0A087WWL8 130 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 CFC1BP0CG36 223 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 CFC1P0CG37 223 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 LRRK2Q5S007 2527 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0J9YY99 117 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 F5H697 171 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 M0R1W7 72 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.65□□□□□ -0.54
SFRP4-201ENST00000436072 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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