RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM4Q8WVI0 70 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIRC1Q969H9 104 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSANTD3Q96H12 275 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB4Q9Y574 426 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPC1Q9Y5U8 109 aa-3.32□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP155O75694 1391 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0Y8G0 127 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 RER1O15258 196 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA21P01568 189 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA5P01569 189 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA4P05014 189 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 KDELR2P33947 212 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 SULT1E1P49888 294 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 AHSA2Q719I0 299 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-3.33□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP164Q9UPV0 1460 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOCK5Q9H7D0 1870 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFF1P04155 84 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A5P33763 92 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRN3P1Q2M238 152 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKAP14Q86UN6 197 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC51BQ86UW2 128 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA11Q86Y39 141 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 WFDC9Q8NEX5 89 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC20Q8TCA0 184 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRK1Q8WUW1 75 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA12Q9UI09 145 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP54Q70EL1 1684 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 HECW1Q76N89 1606 aa-3.34□□□□□ -2.94
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC169A6NNP5 214 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARPC5O15511 151 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGCTO75223 188 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-DRAP01903 254 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA6P56556 154 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 LELP1Q5T871 98 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT222Q8N1A0 295 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CT55Q8WUE5 264 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-3.35□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A087WUJ7 227 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 hADV38S2A0JD32 116 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAG2O95816 211 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HADHBP55084 474 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAL1Q4LDG9 190 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CST9Q5W186 159 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEPN1Q6WQI6 88 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFI27L1Q96BM0 104 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRELID3AQ96N28 172 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-3.36□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRP5O75197 1615 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 BIRC5O15392 142 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL18Q14116 193 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYRM7Q5U5X0 104 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM45BPQ6NSW5 357 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM86BQ8N661 226 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD29Q8N6D5 301 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMDP11532 3685 aa-3.37□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPEGQ15772 3267 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAX1BP3O14907 124 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA6P08185 405 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1E1P36543 226 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRLHP81277 87 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSU1Q15404 277 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6Q795 121 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCL2Q8N4E4 241 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM7Q9BQ49 75 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRGP23470 1445 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-3.38□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-3.38□□□□□ -2.95
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