RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341048.8

ANKRD55-201, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ANKRD55, Length 2,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-201ENST00000341048 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 IGF1P05019 195 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ANKRD55-201ENST00000341048 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 BLCAPP62952 87 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 LAGE3Q14657 143 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ZNF580Q9UK33 172 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 NOTCH2Q04721 2471 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ZFHX3Q15911 3703 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 G3V318 75 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 K7EMI3 77 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 CEND1Q8N111 149 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TMEM86BQ8N661 226 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 NRACQ8N912 160 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ACANP16112 2415 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TM2D2Q9BX73 214 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SCGB2A2Q13296 93 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 Q6ZQT7 251 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 CCDC140Q96MF4 163 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 BRI3O95415 125 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 HLA-DRB4P13762 266 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 Q6ZS46 218 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 METTL26Q96S19 204 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 A0A087WX48 190 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 H3BUA1 57 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TMEM238C9JI98 176 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 H3BVH4 76 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 LY6G6DO95868 133 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 PLNP26678 52 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SMR3AQ99954 134 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 FAM223BA6NKX1 122 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 CFHR3Q02985 330 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 C16orf92Q96LL3 132 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 HIST1H4GQ99525 98 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 KLK15Q9H2R5 256 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 IGLL5B9A064 214 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 E9PLD3 99 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 J3KRW8 73 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ZNF479Q96JC4 524 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ZNF702PQ9H963 129 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 IGLV1-40P01703 118 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 TAL2Q16559 108 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 C12orf74Q32Q52 190 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 Q8N2B8 174 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 MRAP2Q96G30 205 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 ATP6V0BQ99437 205 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 F8VRH5 84 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 H7C1H1 209 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 M0R381 172 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SRD5A1P18405 259 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 PRR9Q5T870 116 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 DUX5Q96PT3 197 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD55-201ENST00000341048 SPRY2O43597 315 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD55-201ENST00000341048 ATP5G2Q06055 141 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD55-201ENST00000341048 USMG5Q96IX5 58 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD55-201ENST00000341048 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD55-201ENST00000341048 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD55-201ENST00000341048 TMEM89A2RUT3 159 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms