RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 OR4C46A6NHA9 309 aa14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 PRR9Q5T870 116 aa14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 PET117Q6UWS5 81 aa14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.98□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.97□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 PF4P02776 101 aa14.96□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 LINC00173Q6ZV60 143 aa14.96□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 ODF3Q96PU9 254 aa14.96□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 M0R143 59 aa14.96□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 SAP30O75446 220 aa14.96□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.96□□□□□ -0.01
SUMO3-201ENST00000332859 NPYP01303 97 aa14.95□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.95□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 MED14OSP0DP75 135 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 LEPP41159 167 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 DEFB131AP59861 70 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 MAP1LC3AQ9H492 121 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 J3KRW8 73 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 IGLC3P0DOY3 106 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 ATOH7Q8N100 152 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF747Q9BV97 191 aa14.94□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 LINC01546A6NGU7 62 aa14.93□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 SMKR1H3BMG3 65 aa14.93□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 CITED1Q99966 193 aa14.93□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 MAP6D1Q9H9H5 199 aa14.93□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 NCR2O95944 276 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 OR2K2Q8NGT1 345 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 KLLNB2CW77 178 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 EREGO14944 169 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 Q6ZQT7 251 aa14.92□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 A0A096LNJ9 63 aa14.91□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 H3BVH4 76 aa14.91□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 TSPOP30536 169 aa14.91□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 ASIPP42127 132 aa14.91□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 TNFRSF6BO95407 300 aa14.9□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 IGLV1-51P01701 117 aa14.9□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 HBDP02042 147 aa14.9□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 HLA-DRB4P13762 266 aa14.9□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 LINC01545Q5VT33 79 aa14.9□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.9□□□□□ -0.02
SUMO3-201ENST00000332859 KNCNA6PVL3 124 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 IGKV3-20P01619 116 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 EVI2AP22794 236 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 IGLL1P15814 213 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 MAJINQ3KP22 176 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 ST20Q9HBF5 79 aa14.89□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 PRSS47A8MTI9 375 aa14.88□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 KIR3DS1Q14943 382 aa14.88□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 DEFB125Q8N687 156 aa14.88□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 C7orf71A4D174 169 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 A8MTW9 85 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 H3BMM0 161 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 CDKN1BP46527 198 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 AMTNQ6UX39 209 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 MRAP2Q96G30 205 aa14.87□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 ODF3L2Q3SX64 289 aa14.86□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 Q6ZN92 141 aa14.86□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 Q8N8P6 123 aa14.86□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 A0A1B0GV90 55 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 OR11H12B2RN74 326 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 GAS8-AS1O95177 125 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF124Q15973 351 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.85□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 NRACQ8N912 160 aa14.84□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.83□□□□□ -0.03
SUMO3-201ENST00000332859 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 H0Y8G0 127 aa14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 FCER1GP30273 86 aa14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 LGALS9CQ6DKI2 356 aa14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.82□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.82□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 NXPH4O95158 308 aa14.82□□□□□ -0.04
SUMO3-201ENST00000332859 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms