RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 RNF223E7ERA6 249 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TCL1BO95988 128 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.32□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 AVPP01185 164 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM101Q96IK0 257 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 MDFICQ9P1T7 246 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 NAV3Q8IVL0 2385 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 A6NDX4 124 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PLXNB1O43157 2135 aa11.31□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 COX7A2P2O60397 106 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 FSHBP01225 129 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TNFRSF6BO95407 300 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM158Q8WZ71 300 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 FOXC2Q99958 501 aa11.3□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV3-48P01763 117 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 IGKCP01834 107 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 HLA-DRB4P13762 266 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 Q96MF0 132 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 TENM4Q6N022 2769 aa11.29□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PGPA6NDG6 321 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 ATP6V0E1O15342 81 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 IGLC6P0CF74 106 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 HERVK_113P63121 156 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PATE2Q6UY27 113 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 PAXXQ9BUH6 204 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 SPG11Q96JI7 2443 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 A0A1B0GUT8 65 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 HAX1O00165 279 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 AMN1Q8IY45 258 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 VPS13CQ709C8 3753 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 C19orf54Q5BKX5 351 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 ODF3Q96PU9 254 aa11.28□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 MED13LQ71F56 2210 aa11.27□□□□□ -0.6
HOXA3-201ENST00000317201 H3BUX3 64 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV1-17P01599 117 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF580Q9UK33 172 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 IGF1P05019 195 aa11.27□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 J3KT08 172 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 CD7P09564 240 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM219Q86XT9 240 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 11.3
HOXA3-201ENST00000317201 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 C19orf71A6NCJ1 209 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 C4orf26Q17RF5 130 aa11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 CR1P17927 2039 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM213A2RRL7 107 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 IGHG2P01859 326 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 GATD1Q8NB37 220 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 DUX5Q96PT3 197 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.25□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 F8W735 103 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 H3BUA1 57 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 MLST8Q9BVC4 326 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ORM2P19652 201 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ASIPP42127 132 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ECSCRQ19T08 205 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A20O43772 301 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFA7O95182 113 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 LEPP41159 167 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 RIGQ13278 110 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 SPANXA1Q9NS26 97 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 DPM2O94777 84 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 NPYP01303 97 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 DEFB112Q30KQ8 113 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 Q6Q795 121 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PRNTQ86SH4 94 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 Q8N1Y9 231 aa11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.9 ms