RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 PEA15Q15121 130 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF876PQ49A33 203 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01551Q86U37 167 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SVIPQ8NHG7 77 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT11Q96G61 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 JPT2Q9H910 190 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 IL36BQ9NZH7 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SSTP61278 116 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 DNLZQ5SXM8 178 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 C18orf15Q96N68 181 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 APLNQ9ULZ1 77 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 P01737 135 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0J9YY99 117 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 FHL2Q14192 279 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 M0R381 172 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.36□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 IGLC6P0CF74 106 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 TPPP3Q9BW30 176 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 SNAI2O43623 268 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 CXCL1P09341 107 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 ERVFC1-1P60608 527 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 ADIRFQ15847 76 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZSN1 163 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 GTSF1Q8WW33 167 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 ISOC2Q96AB3 205 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 RS1O15537 224 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 OR5AL1P0C617 328 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 PTH2Q96A98 100 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 BIN3Q9NQY0 253 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 Q9UF83 564 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 NAT8Q9UHE5 227 aa6.34□□□□□ -1.39
PDE4D-201ENST00000309641 A0A087WWL8 130 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT3O95989 172 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 MED14OSP0DP75 135 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 ADCYAP1P18509 176 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 CRYBA4P53673 196 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 COMMD7Q86VX2 200 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 KMT2AQ03164 3969 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 NXPH4O95158 308 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 PRO0255Q9UI72 69 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 V9GYV3 84 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 RYR3Q15413 4870 aa6.33□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00862A6NCI5 91 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 PAX4O43316 350 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 CRYGDP07320 174 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP82Q8N141 532 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 SFRP2Q96HF1 295 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 FAM210BQ96KR6 192 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 OSTCQ9NRP0 149 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 A0A096LPF7 62 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LCE6AA0A183 80 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM218A2RU14 115 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 A8MWV9 139 aa6.32□□□□□ -1.4
PDE4D-201ENST00000309641 LY6G6CO95867 125 aa6.32□□□□□ -1.4
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