RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.85□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.85□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 PSMB8P28062 276 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N8P6 123 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 AKAP13Q12802 2813 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM89A2RUT3 159 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 MAJINQ3KP22 176 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01559Q495D7 138 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.84□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 Q8N1Y9 231 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 KIR3DS1Q14943 382 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM86BQ8N661 226 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 A0A096LPF7 62 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.83□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 U3KQE9 123 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 MYCNOSP40205 109 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 PIFOQ8TCI5 191 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 CRIP1P50238 77 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 HIVEP2P31629 2446 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 A0A0U1RRA0 63 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.82□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 JPT2Q9H910 190 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV2-11P01706 119 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 MDFICQ9P1T7 246 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 CREBBPQ92793 2442 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF815PA8K554 130 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 M0R2P5 195 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 IGLV1-40P01703 118 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 NPC2P61916 151 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 F8W735 103 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 MLST8Q9BVC4 326 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 A0A0J9YX75 114 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF292O60281 2723 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 A8MWV9 139 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 I3L3M4 83 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 H3BRM9 83 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SFTA2Q6UW10 78 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 A6NJY4 79 aa7.8□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 APOMO95445 188 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 Q6ZQT7 251 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 F5H768 121 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SMIM13P0DJ93 91 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 MRAPQ8TCY5 172 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB4AO15263 64 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 SPXQ9BT56 116 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 DKK2Q9UBU2 259 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 YPEL4Q96NS1 127 aa7.79□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 DAD1P61803 113 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 DEFB125Q8N687 156 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LINC01006Q8NI28 216 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 GAGE10A6NGK3 116 aa7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 LGALS9O00182 355 aa7.77□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 CTRLP40313 264 aa7.77□□□□□ -1.16
TTPAL-201ENST00000262605 APOC4P55056 127 aa7.77□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms