RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 RBAKDNA6NC62 111 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 RNF223E7ERA6 249 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 HERVK_113P61574 105 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 Q6Q795 121 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.19■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa16.18■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa16.18■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 M0QXV9 152 aa16.18■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 ELANEP08246 267 aa16.18■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 NDPQ00604 133 aa16.18■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 TIMD4Q96H15 378 aa16.18■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 A4D1N5 150 aa16.17■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 LY6LH3BQJ8 138 aa16.17■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 TSHBP01222 138 aa16.17■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa16.17■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 HIF1ANQ9NWT6 349 aa16.17■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-33P01772 117 aa16.16■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 DEFB124Q8NES8 71 aa16.16■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 MGPP08493 103 aa16.16■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 BSPH1Q075Z2 132 aa16.16■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 HES1Q14469 280 aa16.16■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.16■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 J3KRW8 73 aa16.15■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa16.15■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 IGHV4-39P01824 125 aa16.15■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.15■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 PRR9Q5T870 116 aa16.15■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 POLEQ07864 2286 aa16.15■□□□□ 0.18
ODC1-201ENST00000234111 BUB3O43684 328 aa16.14■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 ARL3P36405 182 aa16.14■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.14■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 TCF15Q12870 199 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 LINC01620Q4KN68 170 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 C3orf56Q8N813 242 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 AMELXQ99217 191 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 OR10J6PQ8NGY7 276 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa16.13■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 FAM57AQ8TBR7 257 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 Q1RN00 199 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 DYNLRB1Q9NP97 96 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 CEP295Q9C0D2 2601 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 LYNX1G3V0Z9 82 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 SCGB2A1O75556 95 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 LYNX1P0DP58 116 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 NPBQ8NG41 125 aa16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 IGF1P05019 195 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 J3QQQ9 107 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 P0DMU3 169 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 FAM231AP0DMU4 169 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 FAM231CP0DMU5 169 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 ATXN8Q156A1 80 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.11■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 TRAV2A0A0B4J234 112 aa16.1■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 CLEC3BP05452 202 aa16.1■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 PMVKQ15126 192 aa16.1■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 ZFAND3Q9H8U3 227 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 MDFICQ9P1T7 246 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 IGIPA6NJ69 53 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 H3BMM0 161 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 UBE2WQ96B02 151 aa16.09■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 ATMQ13315 3056 aa16.08■□□□□ 0.17
ODC1-201ENST00000234111 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.08■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 FOXC1Q12948 553 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 GPHB5Q86YW7 130 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 LGALS9O00182 355 aa16.07■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 A0A0B4J2C4 111 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 DPM3Q9P2X0 92 aa16.06■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.05■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.05■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.05■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 SVEP1Q4LDE5 3571 aa16.05■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.05■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa16.04■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 C15orf32Q32M92 178 aa16.04■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa16.03■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 TRIAP1O43715 76 aa16.03■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 ZNF56Q15929 161 aa16.03■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 PCNX1Q96RV3 2341 aa16.03■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 C2orf82Q6UX34 121 aa16.03■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 DEFB109BQ30KR1 87 aa16.02■□□□□ 0.16
ODC1-201ENST00000234111 SPANXA1Q9NS26 97 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms