RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637052.1

SYNGAP1-219, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FXYD5	Q96DB9	178 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SYNGAP1-219	ENST00000637052		V9GYH0	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052		L7N2F9	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NDUFB6	O95139	128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FGF7	P21781	194 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	AP3S2	P59780	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	VAMP2	P63027	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE1	Q13065	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE4	Q13068	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE5	Q13069	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052		F6UZH7	168 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RHOH	Q15669	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	BTC	P35070	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052		H3BMQ9	156 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	S100A11	P31949	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CSN1S1	P47710	185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	INPP1	P49441	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SULT1A1	P50225	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052		Q6ZRU5	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NIT1	Q86X76	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	JPT2	Q9H910	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PGP	A6NDG6	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR7C2	O60412	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMBIM6	P55061	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NHLH2	Q02577	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RAB32	Q13637	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RMI2	Q96E14	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CIDEA	O60543	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PRSS1	P07477	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	S100A10	P60903	97 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GNG5	P63218	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IL15RA	Q13261	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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