RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617062.4

CU633904.1-201, humanhuman

TSL 5

Gene CU633904.1, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633904.1-201ENST00000617062 PGPA6NDG6 321 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 PAX4O43316 350 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 FHL2Q14192 279 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 Q6ZQT7 251 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.04□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 ORM1P02763 201 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 TIRAPP58753 221 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 RAB2AP61019 212 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF575Q86XF7 245 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 KCNS1Q96KK3 526 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 MED28Q9H204 178 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 MDFICQ9P1T7 246 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.03□□□□□ -1.44
CU633904.1-201ENST00000617062 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 C16orf90A8MZG2 172 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 M0R2P5 195 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SIVA1O15304 175 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 CIDEAO60543 219 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 ATP6V0CP27449 155 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 PTH2Q96A98 100 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TVP23CQ96ET8 276 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.02□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 A0A1W2PRE2 83 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 K7EQD1 137 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 K7EQM0 130 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 NXPH4O95158 308 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 CXorf1O96002 111 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TCRAP04437 139 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GCHFRP30047 84 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 MUC21Q5SSG8 566 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 RAB24Q969Q5 203 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 HYLS1Q96M11 299 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TREM1Q9NP99 234 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.01□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 RNF222A6NCQ9 220 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GGTLC3B5MD39 225 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 C9JCJ5 164 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 IGLV2-11P01706 119 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 IGHV3-53P01767 116 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TYMSP04818 313 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SRIP30626 198 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 LINC00315P59091 139 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 NFE4Q86UQ8 179 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 ZNF479Q96JC4 524 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 C8orf49Q96NF6 230 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TAAR5O14804 337 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SFTA3P0C7M3 94 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GNG5P63218 68 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 Q5BKY6 102 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 COX8CQ7Z4L0 72 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 C9orf85Q96MD7 179 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 EPDR1Q9UM22 224 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 PSG8Q9UQ74 426 aa5.99□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 F6UZH7 168 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 G3V3Q6 166 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GNRH2O43555 120 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 GYPEP15421 78 aa5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CU633904.1-201ENST00000617062 ZFP69Q49AA0 526 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms