RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 A0A0J9YY99 117 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 RNF222A6NCQ9 220 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 PFDN1O60925 122 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF415Q09FC8 603 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 RGS21Q2M5E4 152 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 TDRG1Q3Y452 100 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZNX1 250 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 Q6ZQT7 251 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 SSX7Q7RTT5 188 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 RAB24Q969Q5 203 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN8-208ENST00000616306 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 SLAQ13239 276 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 SPXQ9BT56 116 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 UPK3BQ9BT76 320 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 A0A096LPF7 62 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 CXorf1O96002 111 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 GCHFRP30047 84 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 MUC21Q5SSG8 566 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 Q9H8V8 135 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM167BQ9NRX6 74 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 MDFICQ9P1T7 246 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 PRO0255Q9UI72 69 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 K7EQM0 130 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TCRAP04437 139 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 GNG5P63218 68 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM183BQ1AE95 376 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 ESRGQ1W209 222 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TTC32Q5I0X7 151 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 RASL10AQ92737 203 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TVP23CQ96ET8 276 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 NDFIP1Q9BT67 221 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TREM1Q9NP99 234 aa7□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 A0A1W2PRE2 83 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 G3V3Q6 166 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TAAR5O14804 337 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 C6orf223Q8N319 242 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 KCNS1Q96KK3 526 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 FAM210AQ96ND0 272 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 EPDR1Q9UM22 224 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.99□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 A0A1W2PPQ1 181 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 GGTLC3B5MD39 225 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 F6UZH7 168 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 IGHV3-53P01767 116 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 CRYBA4P53673 196 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 GAGE13Q4V321 117 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 NAGKQ9UJ70 344 aa6.98□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 M0R2P5 195 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 GNRH2O43555 120 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 IGLV2-11P01706 119 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF726P1Q15940 193 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 PSG8Q9UQ74 426 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN8-208ENST00000616306 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 ARPC5O15511 151 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 TYMSP04818 313 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 ZFP69Q49AA0 526 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 SMUG1Q53HV7 270 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF479Q96JC4 524 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms