RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 ZMAT4Q9H898 229 aa12□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 PRAC2D3DTV9 90 aa11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 C2orf66Q6UXQ4 117 aa11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 GFRALQ6UXV0 394 aa11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF56Q15929 161 aa11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.99□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 I3L2K1 104 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 IGLV1-44P01699 117 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 LYNX1P0DP58 116 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 NPC2P61916 151 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.98□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 K7EIM0 57 aa11.97□□□□□ -0.49
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PDE4C-211ENST00000597360 PAX8Q06710 450 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 PIFOQ8TCI5 191 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 INS-IGF2F8WCM5 200 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 IGLC6P0CF74 106 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 LINC01559Q495D7 138 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 GATD1Q8NB37 220 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 SPRY4Q9C004 299 aa11.97□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 SMIM2Q9BVW6 85 aa11.96□□□□□ -0.49
PDE4C-211ENST00000597360 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.96□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 TIMM23O14925 209 aa11.96□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.96□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ZFHX4Q86UP3 3567 aa11.96□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 TEX22C9J3V5 150 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 TIMD4Q96H15 378 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.95□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ID1P41134 155 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 TACC2O95359 2948 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 PDE6HQ13956 83 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ADIPOQQ15848 244 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ECSCRQ19T08 205 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 C2orf82Q6UX34 121 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 CEACAM4O75871 244 aa11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.58e-6■■□□□ 12.9
PDE4C-211ENST00000597360 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 A4D1N5 150 aa11.93□□□□□ -0.5
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PDE4C-211ENST00000597360 Q6ZS46 218 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 Q8N1Y9 231 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 C17orf100A8MU93 164 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 RHODO00212 210 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 FCN3O75636 299 aa11.93□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
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PDE4C-211ENST00000597360 KALRNO60229 2985 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 FOXC1Q12948 553 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.92□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 C11orf86A6NJI1 115 aa11.91□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
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PDE4C-211ENST00000597360 CFC1P0CG37 223 aa11.91□□□□□ -0.5
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PDE4C-211ENST00000597360 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.91□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.91□□□□□ -0.5
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PDE4C-211ENST00000597360 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
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PDE4C-211ENST00000597360 PIP4P1Q86T03 277 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 NBL1P41271 181 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 C16orf92Q96LL3 132 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.9□□□□□ -0.5
PDE4C-211ENST00000597360 H3BMM0 161 aa11.9□□□□□ -0.51
PDE4C-211ENST00000597360 NDPQ00604 133 aa11.9□□□□□ -0.51
PDE4C-211ENST00000597360 RASL10AQ92737 203 aa11.9□□□□□ -0.51
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