RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 OR1L4Q8NGR5 311 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PRRT1Q99946 306 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 DIRC3C9JPN6 131 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 LYPD6BQ8NI32 183 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MGST2Q99735 147 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 hDV102S1A0JD36 115 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CTDSPLO15194 276 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 AKAIN1P0CW23 69 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PYYP10082 97 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CAV2P51636 162 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 LSM3P62310 102 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MAJINQ3KP22 176 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 C15orf40Q8WUR7 153 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 NRG4Q8WWG1 115 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 LINC00479Q96M42 142 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PFDN5Q99471 154 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.69□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 RBAKDNA6NC62 111 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TMEM262E9PQX1 116 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TCRBP04435 133 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CAMLGP49069 296 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CACNG7P62955 275 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MIAQ16674 131 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MIC13Q5XKP0 118 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZRP5 223 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 STPG4Q8N801 248 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 KCNS1Q96KK3 526 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 Q9UF83 564 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.68□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SSSCA1O60232 199 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CSN1S1P47710 185 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 ID3Q02535 119 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 NEDD8Q15843 81 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 ASB13Q8WXK3 278 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SMIM8Q96KF7 97 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PARLQ9H300 379 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MZT2AQ6P582 158 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PTH2Q96A98 100 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 GGACTQ9BVM4 153 aa5.66□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 SLPIP03973 132 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 VAMP1P23763 118 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 COX6A2Q02221 97 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 ARL16Q0P5N6 197 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 MPV17L2Q567V2 206 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 C9orf85Q96MD7 179 aa5.65□□□□□ -1.5
GGA3-212ENST00000582376 A8MWV9 139 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 IFNA7P01567 189 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 VCX3BQ9H321 246 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 MCUBQ9NWR8 336 aa5.64□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 A0A087WWL8 130 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 F6UZH7 168 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 TSC22D2O75157 780 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 TMED6Q8WW62 240 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 RAB26Q9ULW5 256 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-212ENST00000582376 SFT2D2O95562 160 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms