RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 COX19Q49B96 90 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 ZNF575Q86XF7 245 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 AMBPP02760 352 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 C16orf95Q9H693 158 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 MAST4O15021 2626 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 H3BVH4 76 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 PROK1P58294 105 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 RASL11AQ6T310 242 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 AMN1Q8IY45 258 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 GNRH2O43555 120 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SAP30O75446 220 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 PMCHP20382 165 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 LINC01559Q495D7 138 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 Q6AWC8 147 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 A0A0J9YX75 114 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 M0R381 172 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 S100A8P05109 93 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 LINC00310P59036 64 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SMKR1H3BMG3 65 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CRLF1O75462 422 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 IGLC6P0CF74 106 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 EVI2AP22794 236 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-3P60369 221 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PYY3Q5JQD4 70 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 TMEM18Q96B42 140 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NIT2Q9NQR4 276 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 AMTP48728 403 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FHL3Q13643 280 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PMCHL1Q16048 86 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 D6R8Y8 96 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NCR2O95944 276 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PF4P02776 101 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CD7P09564 240 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NDUFA7O95182 113 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PRM2P04554 102 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CTRLP40313 264 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 Q0VG73 95 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 STAB1Q9NY15 2570 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 HSBP1O75506 76 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FOSL1P15407 271 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CDKN1BP46527 198 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 KLLNB2CW77 178 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 GAS8-AS1O95177 125 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 CKS2P33552 79 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ASIPP42127 132 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 C7orf71A4D174 169 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 OR4C46A6NHA9 309 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NIT1Q86X76 327 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 COL6A5A8TX70 2615 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GW15 77 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 H3BMM0 161 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 SCGB1D1O95968 90 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 SMIM6P0DI80 62 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 KCNS1Q96KK3 526 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 TSPOP30536 169 aa6.23□□□□□ -1.41
CS-215ENST00000549143 LEPP41159 167 aa6.23□□□□□ -1.41
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