RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01548A6NM66 108 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01619G3V211 115 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 J3QR89 54 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 PRR9Q5T870 116 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TOMM6Q96B49 74 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C20orf78Q9BR46 151 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 KLK15Q9H2R5 256 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 M0R381 172 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00477Q96M19 166 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ATP6V0BQ99437 205 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM223BA6NKX1 122 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 J3KRW8 73 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ASIPP42127 132 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 GLMPQ8WWB7 406 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 RRN3P1Q2M238 152 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SAMD13Q5VXD3 122 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C5orf56Q8N8D9 126 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 RASL10AQ92737 203 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C20orf173Q96LM9 149 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 RAXQ9Y2V3 346 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 H3BMG7 143 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 OVOL1O14753 267 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 NPFFO15130 113 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ARL3P36405 182 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 NBL1P41271 181 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SCGB2A2Q13296 93 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ABCA4P78363 2273 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 MGPP08493 103 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 WFDC2Q14508 124 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1B0GWB2 263 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 PPP1R17O96001 155 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 IGF1P05019 195 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 GAGE13Q4V321 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 MED14OSP0DP75 135 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 BAALCQ8WXS3 180 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 SIGMAR1Q99720 223 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 A6NJY4 79 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 KLRB1Q12918 225 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 TMEM219Q86XT9 240 aa7.15□□□□□ -1.26
RRN3P1-202ENST00000546471 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SCGB1A1P11684 91 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 AMTNQ6UX39 209 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF815PA8K554 130 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFA4O00483 81 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SPRY2O43597 315 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 AZU1P20160 251 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 ETDBQ3ZM63 59 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 GPHB5Q86YW7 130 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 UBTD1Q9HAC8 227 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SOCS3O14543 225 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 LMO4P61968 165 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.14□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RNF223E7ERA6 249 aa7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 A0A1W2PPR1 153 aa7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.13□□□□□ -1.27
RRN3P1-202ENST00000546471 PRO0461Q9UI25 63 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms