RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CGB7P0DN87 165 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 WT1-ASQ06250 92 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF581Q9P0T4 197 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 F8VRH5 84 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE6Q13070 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 hDV102S1A0JD36 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-59P01825 116 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf79P0CE67 100 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 KIR3DS1Q14943 382 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TM2D2Q9BX73 214 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 K7EMT4 169 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CD5LO43866 347 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GP9P14770 177 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 RNF138Q8WVD3 245 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2WQ96B02 151 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IGLC7A0M8Q6 106 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C10orf105Q8TEF2 133 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 A0A087X0K7 114 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00479Q96M42 142 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 KNCNA6PVL3 124 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 LTAP01374 205 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TAL2Q16559 108 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 UTF1Q5T230 341 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZWC4 215 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf52Q96A22 123 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 UBL5Q9BZL1 73 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 PRSS47A8MTI9 375 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 PRORYQ9H606 182 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SIVA1O15304 175 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZSR3 168 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 U3KQE9 123 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 MYCNOSP40205 109 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 V9GYV3 84 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM213A2RRL7 107 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 CITED1Q99966 193 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 C5orf24Q7Z6I8 188 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 GPHB5Q86YW7 130 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-226ENST00000546160 IL15RAQ13261 267 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf53Q8IXP5 236 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 C9JAW5 83 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 BUB3O43684 328 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZVH6 145 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 CFHR4Q92496 578 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 CREBBPQ92793 2442 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 K7EQD1 137 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 HLA-DMBP28068 263 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 PFN2P35080 140 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 CEND1Q8N111 149 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 MED14OSP0DP75 135 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 SPANXCQ9NY87 97 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 F8W1H4 67 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 PLA2G5P39877 138 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 UBE2BP63146 152 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-226ENST00000546160 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.01□□□□□ -1.61
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