RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.96□□□□□ -1.78
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CLSTN3-215ENST00000544584 RASL10AQ92737 203 aa3.96□□□□□ -1.78
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 PRO0255Q9UI72 69 aa3.96□□□□□ -1.78
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CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf223Q8N319 242 aa3.92□□□□□ -1.78
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CLSTN3-215ENST00000544584 MBD3L1Q8WWY6 194 aa3.92□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.91□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.91□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.91□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.91□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 GGTLC3B5MD39 225 aa3.91□□□□□ -1.78
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE6DO43924 150 aa3.91□□□□□ -1.78
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