RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529551.1

CPQ-208, Transcript of carboxypeptidase Q, human

TSL 2

Gene CPQ, Length 896 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPQ-208	ENST00000529551	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	MB	P02144	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ASAH1	Q13510	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TRGV9	Q99603	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		U3KQ87	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		A0A1W2PPV4	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		H3BNG1	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	RAB3D	O95716	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	RLN2	P04090	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	IAPP	P10997	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	AP3S2	P59780	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	CXCL6	P80162	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		Q6ZN92	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PRRT1	Q99946	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		H7BYZ3	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	FABP1	P07148	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	CXCL3	P19876	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PSG3	Q16557	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		V9GYH0	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		H3BRN7	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ADAP1	O75689	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	CCR6	P51684	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PRR4	Q16378	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	GPR82	Q96P67	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CPQ-208	ENST00000529551		A0A0B4J2A0	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPQ-208	ENST00000529551	CENPX	A8MT69	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CPQ-208	ENST00000529551		H3BP45	60 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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