RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 RASL10AQ92737 203 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 PRO0461Q9UI25 63 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA4P78363 2273 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 LRBAP50851 2863 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 OR11H12B2RN74 326 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2E1P51965 193 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 OR11H1Q8NG94 326 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 OR11H2Q8NH07 326 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SIGMAR1Q99720 223 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C20orf78Q9BR46 151 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 AZU1P20160 251 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 TCF15Q12870 199 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C16orf92Q96LL3 132 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C20orf173Q96LM9 149 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 J3QR89 54 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 K7ENP7 123 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 IGF1P05019 195 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 AMTNQ6UX39 209 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 GLMPQ8WWB7 406 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PTPRK-217ENST00000524534 RNF223E7ERA6 249 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 CCL21O00585 134 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 GAGE13Q4V321 117 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SPATA25Q9BR10 227 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 AGRNO00468 2067 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ETDBQ3ZM63 59 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 BAALCQ8WXS3 180 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00477Q96M19 166 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ATP6V0BQ99437 205 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 KLK15Q9H2R5 256 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SAA4P35542 130 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ATP5G2Q06055 141 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 M0R381 172 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 CIDEAO60543 219 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 RAXQ9Y2V3 346 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SPRY2O43597 315 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 GPHB5Q86YW7 130 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 MED14OSP0DP75 135 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 ASIPP42127 132 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 J3KRW8 73 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SOCS3O14543 225 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 OVOL1O14753 267 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRK-217ENST00000524534 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 COX6B1P14854 86 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 FAM223BA6NKX1 122 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 MTURNQ8N3F0 131 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF815PA8K554 130 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2D1P51668 147 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 NPFFO15130 113 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 PPP1R17O96001 155 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 CRYGDP07320 174 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 MGPP08493 103 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 INSL3P51460 131 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1W2PPR1 153 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 A6NJY4 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-217ENST00000524534 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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