RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 NRGNQ92686 78 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 MPV17L2Q567V2 206 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 F6UB75 175 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 SLURP1P55000 103 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 PLCE1Q9P212 2302 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 EREGO14944 169 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 Q8N7P7 452 aa13.63□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EMI3 77 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EMT4 169 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 CRYGCP07315 174 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 GP9P14770 177 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 HLA-DMBP28068 263 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 SIRPDQ9H106 197 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.62□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 STPG4Q8N801 248 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 C16orf54Q6UWD8 224 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 NPYP01303 97 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHG2P01859 326 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 U3KQE9 123 aa13.61□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 HERVK_113P63121 156 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 BUB3O43684 328 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 MYCNOSP40205 109 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A1B0GV72 72 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 C2orf82Q6UX34 121 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 RITA1Q96K30 269 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 VWC2LB2RUY7 222 aa13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 CDK2AP2O75956 126 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 MSMPQ1L6U9 139 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 CD5LO43866 347 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 WISP2O76076 250 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 KIR3DS1Q14943 382 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 F8VRH5 84 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 GPHB5Q86YW7 130 aa13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1-202ENST00000517309 NKAPP1Q8N9T2 125 aa13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 GNRH2O43555 120 aa13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 IGLV2-23P01705 113 aa13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 C16orf74Q96GX8 76 aa13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 PIFOQ8TCI5 191 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 CFHR4Q92496 578 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 NDUFA12Q9UI09 145 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 TEX22C9J3V5 150 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 CSPG4Q6UVK1 2322 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa13.57□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 PFN2P35080 140 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A087WW49 117 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ODF3L1Q8IXM7 274 aa13.56□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 C2orf70A6NJV1 201 aa13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 APRG1Q8IVJ8 170 aa13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 FSTL3O95633 263 aa13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 K7EN84 100 aa13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 PATE2Q6UY27 113 aa13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 PCP4P48539 62 aa13.54□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.54□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 A6NDX4 124 aa13.54□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP5G1P05496 136 aa13.54□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 LMO4P61968 165 aa13.54□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 COL4A3Q01955 1670 aa13.53□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.53□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 NCKAP5O14513 1909 aa13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 A0A096LPF7 62 aa13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 MRAPQ8TCY5 172 aa13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00574Q9H8X3 128 aa13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPN13Q12923 2485 aa13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.52□□□□□ -0.24
PTDSS1-202ENST00000517309 ATRXP46100 2492 aa13.52□□□□□ -0.25
PTDSS1-202ENST00000517309 INSL3P51460 131 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms