RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 IL1F10Q8WWZ1 152 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 CCL17Q92583 94 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 METTL26Q96S19 204 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 NAA60Q9H7X0 242 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 RABAC1Q9UI14 185 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 VSIG4Q9Y279 399 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PXMP4Q9Y6I8 212 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.21□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 HERC1Q15751 4861 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 A0A0J9YW62 118 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 LCE6AA0A183 80 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 C9JQL5 133 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 H3BMG7 143 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 C3orf84H3BNL1 204 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 ANGPTL7O43827 346 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 DEDDO75618 318 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PTHP01270 115 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PYYP10082 97 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 CRISP2P16562 243 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 HLA-DMBP28068 263 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SDC2P34741 201 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 ERCC8Q13216 396 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PMCHL1Q16048 86 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 MPV17L2Q567V2 206 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PYDC2Q56P42 97 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 Q6ZVQ6 151 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 COMMD6Q7Z4G1 85 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SLC25A42Q86VD7 318 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PCP2Q8IVA1 136 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF525Q8N782 197 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SCGB1C1Q8TD33 95 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 MYOZ3Q8TDC0 251 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM230Q96A57 120 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 RAB37Q96AX2 223 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 C4orf45Q96LM5 186 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 IMMP1LQ96LU5 166 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SRXN1Q9BYN0 137 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TTTY12Q9BZ98 90 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 IMUPQ9GZP8 106 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 AIG1Q9NVV5 245 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TAAR3PQ9P1P4 343 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PRO0461Q9UI25 63 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 ANAPC10Q9UM13 185 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 FIS1Q9Y3D6 152 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PLCE1Q9P212 2302 aa2.2□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 A0A087WZ39 114 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 PINLYPA6NC86 204 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 KLLNB2CW77 178 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 UMAD1C9J7I0 102 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 H0Y9J4 135 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 M0R129 80 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 FFAR1O14842 300 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SNCGO76070 127 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 APOMO95445 188 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 APOC2P02655 101 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 FABP2P12104 132 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 COX7CP15954 63 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TAS2R45P59539 299 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 CENPWQ5EE01 88 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 SPANXN4Q5MJ08 99 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM91Q6ZNR0 172 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 WDR86Q86TI4 376 aa2.19□□□□□ -2.06
ATXN3-211ENST00000511362 Q8N377 158 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms