RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 COX6B1P14854 86 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00477Q96M19 166 aa9.94□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 JMJD1CQ15652 2540 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PRX2 142 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 CRYGBP07316 175 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 NPBQ8NG41 125 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 ZZEF1O43149 2961 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 BUB3O43684 328 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 MYCNOSP40205 109 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 COX8AP10176 69 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 HSD52Q0P140 79 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.92□□□□□ -0.82
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RABGEF1-211ENST00000503687 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 GNRH2O43555 120 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 SEC11AP67812 179 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 TACC2O95359 2948 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV1-69P01742 117 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 CSTL1Q9H114 145 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRBP23467 1997 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 CD5LO43866 347 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNJ2BPP57105 145 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 ACANP16112 2415 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 TRBV12-3P01733 135 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 K7ERJ3 54 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV2-11P01706 119 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF815PA8K554 130 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 SYT8Q8NBV8 401 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-211ENST00000503687 CTRLP40313 264 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.9□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 OVOL1O14753 267 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 C19orf84I3L1E1 186 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.89□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.89□□□□□ -0.83
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RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 IGF1P05019 195 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 LY6LH3BQJ8 138 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 IGHV4-39P01824 125 aa9.88□□□□□ -0.83
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RABGEF1-211ENST00000503687 CST9LQ9H4G1 147 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GWB2 263 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 GAS8-AS1O95177 125 aa9.88□□□□□ -0.83
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RABGEF1-211ENST00000503687 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N976 141 aa9.88□□□□□ -0.83
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RABGEF1-211ENST00000503687 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.88□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF479Q96JC4 524 aa9.88□□□□□ -0.83
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RABGEF1-211ENST00000503687 K7EP13 123 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZQT7 251 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.87□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0U1RRA0 63 aa9.87□□□□□ -0.83
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RABGEF1-211ENST00000503687 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NJY4 79 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N8P6 123 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 SIRPDQ9H106 197 aa9.86□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF223E7ERA6 249 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC140Q96MF4 163 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.85□□□□□ -0.83
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