RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491228.1

LRP2-204, Transcript of LDL receptor related protein 2, human

TSL 4

Gene LRP2, Length 556 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP2-204	ENST00000491228	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	CAD	P27708	2225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228		A0A096LNJ9	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228		A6NDX4	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228		H3BVH4	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	VCY	O14598	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	IGHG4	P01861	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	FGF6	P10767	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	ATP5J2	P56134	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	GPHB5	Q86YW7	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	PRORY	Q9H606	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LRP2-204	ENST00000491228	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		A0A1W2PPM0	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		F8W1H4	67 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		H3BUT2	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		H3BUX3	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	MGP	P08493	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CFHR3	Q02985	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CEND1	Q8N111	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	VCX2	Q9H322	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SVIL	O95425	2214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NXPH4	O95158	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	RHOH	Q15669	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NRAC	Q8N912	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		Q96MF0	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NCOR1	O75376	2440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	VCAN	P13611	3396 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		A0A087WW49	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228		E9PLD3	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	LGALS9	O00182	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SOCS3	O14543	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	GNLY	P22749	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PLCE1	Q9P212	2302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	KLLN	B2CW77	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PMVK	Q15126	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CDSN	Q15517	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRP2-204	ENST00000491228	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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