RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 RGS21Q2M5E4 152 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 Q8N3U1 123 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 RASL10AQ92737 203 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 TREM1Q9NP99 234 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 Q9UF83 564 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C5-210ENST00000489842 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.14□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 A0A1W2PPV4 95 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PTTG1O95997 202 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 ATP6V0CP27449 155 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TAS2R45P59539 299 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 Q6ZSN1 163 aa6.14□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GGTLC3B5MD39 225 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 M0R2P5 195 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGLV2-11P01706 119 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GCHFRP30047 84 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PRNTQ86SH4 94 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.13□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 RAB24Q969Q5 203 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SPXQ9BT56 116 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GCGP01275 180 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3-30P01768 117 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3-33P01772 117 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TCRAP04437 139 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 CRYGDP07320 174 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 STAG3L2P0CL84 134 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 STAG3L3P0CL85 134 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 ERVFC1-1P60608 527 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SLAQ13239 276 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF726P1Q15940 193 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TDRG1Q3Y452 100 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 ASB13Q8WXK3 278 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 JPT2Q9H910 190 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 Q9HAA7 133 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PSG8Q9UQ74 426 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 RS1O15537 224 aa6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PET100P0DJ07 73 aa6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 UBE2G2P60604 165 aa6.11□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 TMED6Q8WW62 240 aa6.11□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.1□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 EPM2AB3EWF7 344 aa6.1□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 EVI2AP22794 236 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PPT1P50897 306 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 Q6ZNX1 250 aa6.1□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 C9orf85Q96MD7 179 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 EPDR1Q9UM22 224 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 RNF222A6NCQ9 220 aa6.09□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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GTF3C5-210ENST00000489842 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE1Q13065 139 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE4Q13068 117 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE5Q13069 117 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE13Q4V321 117 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 Q5VSD8 79 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C5-210ENST00000489842 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.09□□□□□ -1.43
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