RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489630.5

VWA3B-217, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 2

Gene VWA3B, Length 2,575 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-217ENST00000489630 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.87□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 MRAP2Q96G30 205 aa7.87□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 J3QR89 54 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 CD3EP07766 207 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 TAL2Q16559 108 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01560Q8TB33 94 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 RAX2Q96IS3 184 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SPATA25Q9BR10 227 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 CACNA1BQ00975 2339 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 PLNP26678 52 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 ABCA4P78363 2273 aa7.86□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 BUB3O43684 328 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 C15orf32Q32M92 178 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SFTA2Q6UW10 78 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 A0A1B0GWB2 263 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 ODF3BA8MYP8 253 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 H3BVH4 76 aa7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 F8VRH5 84 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 H7C1H1 209 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 ECSCRQ19T08 205 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 RBAKDNA6NC62 111 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 PRR9Q5T870 116 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 Q8NA96 180 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 C20orf78Q9BR46 151 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.84□□□□□ -1.15
VWA3B-217ENST00000489630 IGF1P05019 195 aa7.83□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.83□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 Q8N6K4 173 aa7.83□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.83□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 M0R381 172 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 APOMO95445 188 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 PRTN3P24158 256 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 RAXQ9Y2V3 346 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 MED13LQ71F56 2210 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 CCDC140Q96MF4 163 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 TTC28Q96AY4 2481 aa7.82□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 Q8N9W7 124 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 RASL10AQ92737 203 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 RELNP78509 3460 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01549A6NIU2 74 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 TOMM6Q96B49 74 aa7.81□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01548A6NM66 108 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF815PA8K554 130 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 G3V318 75 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 M0R1W7 72 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ATP6V0E1O15342 81 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 NFE4Q86UQ8 179 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SYT8Q8NBV8 401 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 BAALCQ8WXS3 180 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 LINC01619G3V211 115 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SLC25A16P16260 332 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 PSMB2P49721 201 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 DEFB1P60022 68 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 PTH2Q96A98 100 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 SPTBN2O15020 2390 aa7.8□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 MGPP08493 103 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 EMP1P54849 157 aa7.79□□□□□ -1.16
VWA3B-217ENST00000489630 FOXI1Q12951 378 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms