RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 SLAQ13239 276 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 SNURFLB1AK76 121 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 APCSP02743 223 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 LINC00315P59091 139 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 SVIPQ8NHG7 77 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.73□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 GPX1P07203 203 aa4.73□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.72□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 S100A6P06703 90 aa4.72□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 SMIM6P0DI80 62 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 MAJINQ3KP22 176 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CFAP161Q6P656 301 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.72□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 SGK494Q96LW2 274 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.72□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 RBMY1CP0DJD4 496 aa4.72□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.72□□□□□ -1.65
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PRKCI-202ENST00000476635 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.71□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.71□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 PMCHP20382 165 aa4.71□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 PRR27Q6MZM9 219 aa4.71□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.71□□□□□ -1.65
PRKCI-202ENST00000476635 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.71□□□□□ -1.66
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PRKCI-202ENST00000476635 POLQO75417 2590 aa4.71□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 CREBBPQ92793 2442 aa4.71□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa4.71□□□□□ -1.66
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF688P0C7X2 276 aa4.71□□□□□ -1.66
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PRKCI-202ENST00000476635 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 ZFP82Q8N141 532 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 NRACQ8N912 160 aa4.7□□□□□ -1.66
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PRKCI-202ENST00000476635 DEFB131AP59861 70 aa4.7□□□□□ -1.66
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PRKCI-202ENST00000476635 MED13LQ71F56 2210 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 OR11H12B2RN74 326 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 C20orf78Q9BR46 151 aa4.7□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 PPP1R17O96001 155 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 INSP01308 110 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 GZMBP10144 247 aa4.69□□□□□ -1.66
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PRKCI-202ENST00000476635 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 SPRY2O43597 315 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 NPSP0C0P6 89 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 RAB4BP61018 213 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 DUX3Q96PT4 197 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 TCL1AP56279 114 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 RASL10AQ92737 203 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.69□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.68□□□□□ -1.66
PRKCI-202ENST00000476635 SPINK4O60575 86 aa4.68□□□□□ -1.66
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