RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 J3QL48 77 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 ORM1P02763 201 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TYMSP04818 313 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 Q8N814 137 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 SPXQ9BT56 116 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-209ENST00000473257 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 RBAKDNA6NC62 111 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 PGPA6NDG6 321 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 M0R2P5 195 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.45□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TDRG1Q3Y452 100 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ATP5SQ99766 215 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 NMES1Q9C002 83 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 WFDC1Q9HC57 220 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TREM1Q9NP99 234 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 MBD2Q9UBB5 411 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 Q9UF83 564 aa7.44□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 H2BFSP57053 126 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 RAB2AP61019 212 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ZNF876PQ49A33 203 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 KHDC3LQ587J8 217 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 OTORQ9NRC9 128 aa7.43□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 K7EP13 123 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 RS1O15537 224 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TIRAPP58753 221 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ASB13Q8WXK3 278 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 HSPB11Q9Y547 144 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.42□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ASAH1Q13510 395 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 BAALCQ8WXS3 180 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 CCDC32Q9BV29 185 aa7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 GAGE12JA6NER3 117 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R45P59539 299 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 IFITM3Q01628 133 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 GAGE1Q13065 139 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 GAGE4Q13068 117 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 GAGE5Q13069 117 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 GAGE13Q4V321 117 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 LELP1Q5T871 98 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 TMED6Q8WW62 240 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 JPT2Q9H910 190 aa7.4□□□□□ -1.22
ACTB-209ENST00000473257 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 RHOHQ15669 191 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 Q6ZSA8 131 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 ENKURQ8TC29 256 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 C9orf85Q96MD7 179 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.39□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 MPC2O95563 127 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 GCGP01275 180 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 SCXQ7RTU7 201 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 KCNS1Q96KK3 526 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPV4 95 aa7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
ACTB-209ENST00000473257 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.37□□□□□ -1.23
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