RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 OR51I2Q9H344 312 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 MAP1LC3AQ9H492 121 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 ENY2Q9NPA8 101 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 COX16Q9P0S2 106 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CEP290O15078 2479 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 LRBAP50851 2863 aa-1.54□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 PTPRMP28827 1452 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 EVC2Q86UK5 1308 aa-1.55□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 FAM159BA6NKW6 160 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 FTCDNL1E5RQL4 147 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 DEGS1O15121 323 aa-1.55□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 PSMB6P28072 239 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TNNC1P63316 161 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 H3F3AP84243 136 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 AKIRIN2Q53H80 203 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CST9Q5W186 159 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CLEC2BQ92478 149 aa-1.55□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 RAB8BQ92930 207 aa-1.55□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-1.55□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-1.56□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 ZNF609O15014 1411 aa-1.56□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 NUP155O75694 1391 aa-1.56□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 RBAKDNA6NC62 111 aa-1.56□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 H0YGG7 62 aa-1.56□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 J3KT08 172 aa-1.56□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-1.57□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-1.57□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 M0R2P5 195 aa-1.57□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 EDF1O60869 148 aaKnown RBP-1.57□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 ARL5CA6NH57 179 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM210A6NLX4 147 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CNIH1O95406 144 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 MT-ND6P03923 174 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 TCRBP04435 133 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 RBP1P09455 135 aa-1.58□□□□□ -2.66
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