RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TSSC4-208	ENST00000467308	NEU1	Q99519	415 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TSSC4-208	ENST00000467308	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TSSC4-208	ENST00000467308	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF492	Q9P255	531 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TSSC4-208	ENST00000467308	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	HSPG2	P98160	4391 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308		H3BMM0	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ERCC8	Q13216	396 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308		F6UB75	175 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	CT45A10	P0DMU9	189 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	CRISP2	P16562	243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF212	Q495C1	297 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	SVBP	Q8N300	66 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	OCC1	Q8TAD7	63 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	GCG	P01275	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	DEFB1	P60022	68 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308		B4DEV8	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	APOC3	P02656	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	AMTN	Q6UX39	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308		Q8TAT8	98 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	SGK494	Q96LW2	274 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308		K7EN84	100 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	SNAPIN	O95295	136 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	TSPO	P30536	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	LEP	P41159	167 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	EMP1	P54849	157 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	DKK2	Q9UBU2	259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TSSC4-208	ENST00000467308	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	KLLN	B2CW77	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	RHEB	Q15382	184 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	CDK2AP2	O75956	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	ADIRF	Q15847	76 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308		A0A087WWC5	75 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308		Q6AWC8	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308		M0R036	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	CDKN1B	P46527	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	CRIP1	P50238	77 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	C16orf90	A8MZG2	172 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	MT-ND4L	P03901	98 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	GPX1	P07203	203 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	OR5I1	Q13606	314 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	HTN3	P15516	51 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	FXYD7	P58549	80 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	CT83	Q5H943	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	PRR9	Q5T870	116 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TSSC4-208	ENST00000467308	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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