RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 TRGV9Q99603 122 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 V9GYV3 84 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 S4R3C0 116 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 J3KT08 172 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 SAP30O75446 220 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 IGLV2-23P01705 113 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 CEND1Q8N111 149 aa6.06□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 IGHG4P01861 327 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 EVI2AP22794 236 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 RNF125Q96EQ8 232 aa6.05□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 LINC01619G3V211 115 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 CDSNQ15517 529 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 C15orf32Q32M92 178 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.05□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 LY6LH3BQJ8 138 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 HLA-DMBP28068 263 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 SLC25A20O43772 301 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-48P01763 117 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 PRR20EP86478 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 PRR20CP86479 221 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 PRR20DP86480 221 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 PRR20AP86496 221 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.04□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 ODF3BA8MYP8 253 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 STHQ8IWL8 128 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 VCYO14598 125 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 PDE6HQ13956 83 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 HIGD1BQ9P298 99 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 FRYLO94915 3013 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPI3 338 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 H3BMG7 143 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 OVOL1O14753 267 aa6.03□□□□□ -1.44
USP54-210ENST00000466048 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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USP54-210ENST00000466048 C12orf74Q32Q52 190 aa6.02□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 NDUFC2O95298 119 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 WT1-ASQ06250 92 aa6.02□□□□□ -1.45
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USP54-210ENST00000466048 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 CRPP02741 224 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 TEN1Q86WV5 123 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 Q8N8P6 123 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 AJUBAQ96IF1 538 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 CGB1A6NKQ9 187 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 ATP6V0E1O15342 81 aa6.02□□□□□ -1.45
USP54-210ENST00000466048 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.02□□□□□ -1.45
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