RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PRAC2D3DTV9 90 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGLV1-40P01703 118 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 EVI2AP22794 236 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DMBP28068 263 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 HSD52Q0P140 79 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LAGE3Q14657 143 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ZNF575Q86XF7 245 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 GPHB5Q86YW7 130 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ODF3Q96PU9 254 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.5□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 K7EP13 123 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 DPM2O94777 84 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PRSS1P07477 247 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LEPP41159 167 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ASIPP42127 132 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TFPI2P48307 235 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 Q96MF0 132 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 AP1S3Q96PC3 154 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.49□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 C7orf71A4D174 169 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LINC01548A6NM66 108 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 H3BRM9 83 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 SOCS3O14543 225 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGKCP01834 107 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 NPSP0C0P6 89 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PF4V1P10720 104 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PLNP26678 52 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TAL2Q16559 108 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 RNF182Q8N6D2 247 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 H0Y8G0 127 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 H3BUX3 64 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TAX1BP3O14907 124 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 SMIM17P0DL12 118 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 VAMP3Q15836 100 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TMEM219Q86XT9 240 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 FBN2P35556 2912 aa6.47□□□□□ -1.37
ACTB-208ENST00000464611 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WW49 117 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 FGF6P10767 208 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 CFHR3Q02985 330 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 ODF1Q14990 250 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 TEX29Q8N6K0 151 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 NRACQ8N912 160 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.46□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WX48 190 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 LINC01619G3V211 115 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 SMKR1H3BMG3 65 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 H7C1H1 209 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 LGALS9O00182 355 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 CCL25O15444 150 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 NXPH4O95158 308 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 NCR2O95944 276 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 ELANEP08246 267 aa6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
ACTB-208ENST00000464611 TM4SF20Q53R12 229 aa6.45□□□□□ -1.38
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