RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-210	ENST00000463041	TAAR5	O14804	337 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	CIDEA	O60543	219 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	ORM1	P02763	201 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	GCHFR	P30047	84 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041		Q5BKY6	102 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	EPDR1	Q9UM22	224 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041		A0A1W2PRE2	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	NXPH4	O95158	308 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TCRA	P04437	139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	GNG5	P63218	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041		C9JCJ5	164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041		K7EQD1	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TYMS	P04818	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	GYPE	P15421	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SRI	P30626	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	PTH2	Q96A98	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041		F6UZH7	168 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	GCG	P01275	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TIRAP	P58753	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	LINC00315	P59091	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPRF-210	ENST00000463041	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	EREG	O14944	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	RS1	O15537	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	IFNA7	P01567	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	EVI2A	P22794	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	PPT1	P50897	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		A8MWV9	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041		G3V3Q6	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRF-210	ENST00000463041	PEX7	O00628	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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