RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD13Q5VXD3 122 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LURAP1LQ8IV03 231 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TEX29Q8N6K0 151 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf92Q96LL3 132 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ODF3Q96PU9 254 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 NAGKQ9UJ70 344 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 HIVEP1P15822 2718 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 AGRNO00468 2067 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS47A8MTI9 375 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf79P0CE67 100 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 MED14OSP0DP75 135 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FHL3Q13643 280 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TDRG1Q3Y452 100 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZSV7 163 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA12Q7Z6I5 190 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF738Q8NE65 137 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf95Q9H693 158 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM160Q9NX00 188 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 SORL1Q92673 2214 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 NOTCH2Q04721 2471 aa4.21□□□□□ -1.73
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YX75 114 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 F6UB75 175 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 M0QZ24 198 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RAB4AP20338 218 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 PMCHP20382 165 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 NTF3P20783 257 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 AMTP48728 403 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 KIR3DS1Q14943 382 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 AMN1Q8IY45 258 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 JMJD1CQ15652 2540 aa4.21□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 D6R8Y8 96 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 GAS8-AS1O95177 125 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 NPYP01303 97 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ORM1P02763 201 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 LINC00614P0C842 121 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 DDTP30046 118 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SYNJ2BPP57105 145 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00315P59091 139 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 DUX5Q96PT3 197 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.2□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
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PTPRC-210ENST00000462363 BORCS7Q96B45 105 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf144Q96I85 54 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 PRELID3AQ96N28 172 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF747Q9BV97 191 aa4.19□□□□□ -1.74
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