RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462323.5

MUC4-208, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 5

Gene MUC4, Length 16,197 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-208	ENST00000462323		U3KQA8	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ACYP1	P07311	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	GAFA1	Q96PS6	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NBL1	P41271	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LTA	P01374	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RASL10A	Q92737	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	DKK1	O94907	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRR20E	P86478	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRR20C	P86479	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRR20D	P86480	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRR20B	P86481	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRR20A	P86496	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TIMM23	O14925	209 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	DAD1	P61803	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CCL3L1	P16619	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		H3BT86	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CCL21	O00585	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TFF1	P04155	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PSME4	Q14997	1843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PF4	P02776	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NDUFS7	O75251	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TCF15	Q12870	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LGALS9	O00182	355 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRB1	P04280	392 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		Q86TA4	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRGV3	P03979	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		A0A0B4J2C4	111 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323		D6R8Y8	96 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CRYGD	P07320	174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LINC00205	P59089	165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PDE6H	Q13956	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	NDUFS5	O43920	106 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	MLANA	Q16655	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CXCL5	P42830	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	ATOX1	O00244	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MUC4-208	ENST00000462323	OVOL1	O14753	267 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	CD59	P13987	128 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	COX7C	P15954	63 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		A8MZ25	164 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323		K7EMI3	77 aa		4.59	□□□□□ -1.68
MUC4-208	ENST00000462323	IGHG2	P01859	326 aa		4.59	□□□□□ -1.68

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