RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 IGLL5B9A064 214 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 K7EN84 100 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 BTN1A1Q13410 526 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 KIR3DS1Q14943 382 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 PRR9Q5T870 116 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 PRR27Q6MZM9 219 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 ATP6V1G1O75348 118 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 INSP01308 110 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 APOC3P02656 99 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 OR5I1Q13606 314 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 ISOC2Q96AB3 205 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-208ENST00000438888 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 M0R036 132 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 SH2D1AO60880 128 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 CRIP1P50238 77 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 Q6AWC8 147 aa8.96□□□□□ -0.98
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PRAME-208ENST00000438888 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 XCL2Q9UBD3 114 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 HERC2O95714 4834 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 ERVFC1-1P60608 527 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 Q8NAQ8 132 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 APLNQ9ULZ1 77 aa8.95□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 SNAPINO95295 136 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 P01737 135 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 SFRP2Q96HF1 295 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 OSTCQ9NRP0 149 aa8.94□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 B4DEV8 164 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 MT-ND4LP03901 98 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 S100A1P23297 94 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZQT7 251 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZTC4 211 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 NUDT11Q96G61 164 aa8.93□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 NAGKQ9UJ70 344 aa8.93□□□□□ -0.98
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 H7BYZ3 331 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 ORM1P02763 201 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RHEBQ15382 184 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 LINC01559Q495D7 138 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 MUC21Q5SSG8 566 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 TMEM189A5PLL7 270 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 PPP1R2P9O14990 202 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 MIFP14174 115 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 TCTAP57738 103 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RNF212Q495C1 297 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 LINC01587Q99440 93 aa8.91□□□□□ -0.98
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PRAME-208ENST00000438888 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.91□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 CT83Q5H943 113 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 KCNS1Q96KK3 526 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 CELA1Q9UNI1 258 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 V9GYV3 84 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 X6R8D5 127 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-208ENST00000438888 A0A087WWC5 75 aa8.89□□□□□ -0.99
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