RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	NMS	Q5H8A3	153 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR107	Q5VW38	600 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF738	Q8NE65	137 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	DTD1	Q8TEA8	209 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	AP3S1	Q92572	193 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR146	Q96CH1	333 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	TRGV9	Q99603	122 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	UPK3B	Q9BT76	320 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	NAA60	Q9H7X0	242 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		2.28	□□□□□ -2.04
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A0G2JRQ6	117 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A0J9YY99	117 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF98	A6NK75	572 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		A8MTW9	85 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	DISC1	C4P0D8	188 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		H3BNG1	76 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		H7BYZ3	331 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB3D	O95716	219 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	PRM2	P04554	102 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ANXA3	P12429	323 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ORM2	P19652	201 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	CDKN1B	P46527	198 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SMCO1	Q147U7	214 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		Q5VSD8	79 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	AMTN	Q6UX39	209 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	BAP18	Q8IXM2	172 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	OR1S1	Q8NH92	325 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	PRRT1	Q99946	306 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	RBKS	Q9H477	322 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	MYCBP2	O75592	4640 aa		2.27	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A087WXM4	84 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A0B4J2A0	478 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SIVA1	O15304	175 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	HPGDS	O60760	199 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	HYPM	O75409	117 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	IL5	P05113	134 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	TGFBR1	P36897	503 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	AKR1C1	Q04828	323 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	PSG3	Q16557	428 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	ESRG	Q1W209	222 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	C18orf15	Q96N68	181 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	FAT1	Q14517	4588 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1B0GWB2	263 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SMCO3	A2RU48	225 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283		K7EP13	123 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	RGS5	O15539	181 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5G3	P0C626	314 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	AKAIN1	P0CW23	69 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	IAPP	P10997	89 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	CXCL2	P19875	107 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	CXCL3	P19876	107 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	EVI2A	P22794	236 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	LEP	P41159	167 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	VBP1	P61758	197 aa		2.25	□□□□□ -2.05
PTPN4-204	ENST00000431283	NCS1	P62166	190 aa		2.25	□□□□□ -2.05

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